"Дефект может давать не какая-то конкретная особь, а сочетание генов при вязке двух собак, каждая из которых от дефекта свободна."
Не совсем правильно, т.к. если дефект проявился в потомстве, значит он УЖЕ БЫЛ в генотипе родителей. Из ничего ничего не появляется (бывают единичые случаи мутаций, но к данной теме это отношения не имеет).
Возможность появления какого-либо признака у потомка чаще всего связана с типом его наследования. Если данный признак был обусловлен доминантным геном, то он ОБЯЗАТЕЛЬНО выражен у одного из родителей, если рециссивным, то он внешне не выражен у родителей, но проявляется у детей.
Если упростить ситуацию, то две ВНЕШНЕ здоровые собаки несут в рециссивном состоянии ген, отвечающий за появление какого-либо дефекта. Повязав их между собой мы получим часть здоровых собак, часть ВНЕШНЕ здоровых собак, несущих данный признак в генотипе и часть собак у которых этот признак выражен фенотипически, т.к. гомозигоных по рециссивному гену. (Менделевское соотношене 1:2:1).
На тему указания дефектов в акте обследования помета - если щенки были отбракованы, то информация об этом должна быть указана в акте, с обязательным указанием №№ клейм данных щенков. Другое дело, если заводчик, заботясь "о чистоте мундира", просто не включает таких щенков в число актированных и не клеймит их.
Но... это уже другая история.